随着蛋白质组学研究的深入，科研人员面临的样本数量不断增加，尤其是在多组学联合分析、疾病队列研究和药物筛选等应用场景中，对高通量、高准确性的定量技术需求愈发迫切。在众多定量策略中，TMT（Tandem Mass Tag）定量凭借其出色的多重通道标记能力（可实现最多18通道样本并行分析）、高重复性和较低的批间差异，已成为蛋白组学定量研究的主流方法之一。当前市场上主流的TMT定量平台各具优势，如Orbitrap Eclipse具备超高分辨率与优越的扫描速率，适合高复杂度样本的深度分析；Exploris 480则在高通量筛选任务中表现稳定。科研人员在选择TMT定量平台时，往往面临诸多技术参数、应用场景与预算之间的权衡。因此，本文将围绕主流TMT定量平台的性能特点、影响定量效果的关键因素，以及不同研究目标下的选型建议进行系统梳理。

一、主流TMT定量平台的性能特点分析

目前用于TMT定量的主流质谱平台包括Orbitrap Fusion Lumos、Orbitrap Eclipse Tribrid、Exploris 480、Orbitrap Ascend等。Orbitrap Fusion Lumos具备较高分辨率和中等扫描速率，支持TMT 11-plex和16-plex，适合基础研究及翻译后修饰分析。Orbitrap Eclipse在此基础上升级了扫描速度和定量能力，支持TMTpro 18-plex，适用于复杂样本和大规模队列研究。Exploris 480虽然分辨率略低于前两者，但扫描效率高、稳定性好，是高通量筛选型实验的理想选择。而新一代Orbitrap Ascend质谱平台则在分辨率、采集速率与动态范围上进一步提升，针对TMT定量进行了系统优化，特别适合需要极高通量和超深覆盖度的前沿研究项目。部分实验室也在探索将timsTOF Pro与TMT策略结合使用，但由于其原生支持的并非同位素标记定量，需对前处理和分析流程做出特殊优化，建议在经验丰富的服务平台指导下使用。

二、影响TMT定量效果的关键因素

除了质谱平台的配置，TMT定量的效果还受到样本前处理、标签纯度、反应效率以及数据分析策略等多个因素的综合影响。

1、样本前处理流程的标准化尤为关键

TMT定量对样本间的一致性要求极高，轻微的误差可能会被信号放大，影响最终定量结果。建议采用BCA法精确测定蛋白浓度，并确保酶解反应和标签反应时间的一致性。

2、TMT标签本身的纯度与各通道上样量的平衡也需严格控制

应选用MS级高纯度标签，确保各通道反应效率一致。通过高精度上样系统可降低标签交叉污染与批间偏倚。

在数据分析阶段，应根据平台特点选用合适的软件工具，如Proteome Discoverer、MaxQuant、Spectronaut等，结合批次效应校正（如Normalization、Batch Correction）策略，提升定量结果的准确性和可比性。

三、不同研究目标下的TMT平台选型建议

针对不同科研目标，所需的定量深度、通量及数据稳定性各不相同，从而影响TMT平台的选择策略。若研究聚焦于肿瘤标志物筛选，推荐使用Orbitrap Eclipse或Ascend平台，结合高通量18-plex TMT方案与多维分级系统，提升检测灵敏度和蛋白覆盖度。在药物机制研究中，Orbitrap Fusion Lumos或Exploris 480平台可结合中通量11-plex方案，满足效率与成本的平衡。

若研究需与转录组、代谢组等数据联合建模，Orbitrap Eclipse平台因其稳定性和数据一致性表现优异，特别适合多组学整合分析。对于单细胞样本或低起始量样本，推荐采用TMT-Boost策略或纳升级定量方法。

四、百泰派克生物科技的TMT定量服务优势

百泰派克生物科技构建了完整的一站式TMT定量解决方案，涵盖样本处理、TMT标记、高分辨率质谱检测、生信分析及生物学解读五大模块。

• 多种高端质谱平台，包括Orbitrap Eclipse、Fusion Lumos、Exploris 480等，满足不同通量和深度的定量需求；
• 配套自动化蛋白处理系统，确保实验操作标准化与高重现性；
• 在标签纯度控制和上样平衡方面实施双重质控机制，显著提升数据一致性。

此外，我们配备专业生信分析团队，提供从蛋白定量结果解读、通路富集分析到多组学联合模型构建的深度服务，助力客户高效挖掘生物学意义。

TMT定量技术已经成为现代蛋白组学研究中不可或缺的重要工具。不同TMT定量平台在分辨率、通量、灵敏度与稳定性上的差异，决定了其在不同研究场景中的适用性。科研人员在选型时，需充分结合项目目标、样本特点与预算条件，做出科学合理的技术决策。百泰派克生物科技依托完善的质谱平台体系、标准化的操作流程与经验丰富的科研团队，致力于为客户提供高质量、定制化的TMT定量服务。我们不仅关注实验数据本身的准确性，更重视其背后的生物学价值挖掘，助力您的科研项目从数据走向发现，从发现走向突破。

百泰派克生物科技特色项目

一、蛋白测序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos质谱仪及岛津公司埃德曼降解测序系统对蛋白质序列进行分析，提供基于质谱的蛋白测序分析服务，包括对蛋白质的氨基酸组成分析，N端测序，C端测序和全序列分析，以及基于埃德曼降解的蛋白质N端序列分析服务。对于未知理论序列的蛋白质，提供基于从头测序法的蛋白质从头测序服务，对蛋白序列进行分析。

※服务优势：

1.采用目前世界上先进的质谱仪器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可实现对所测定靶蛋白序列 100% 的覆盖;

3.可测定蛋白N端多达 70个氨基酸序列;

4.可测定多种形式的样品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白条带;

5.样品用量低: 蛋白样品仅需 5-10ug，即可完成检测;

6.测序不受N端封闭，PEC和和糖基化等N端修饰的影响。

二、蛋白质组学

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos质谱平台结合Nano-LC，提供定量蛋白质组学、靶向蛋白质组学、多肽组学、翻译后修饰蛋白组学等多种蛋白质组学分析服务。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4D蛋白质组学服务，助力微量样本蛋白组学、大样本群医学及高通量修饰组学等研究工作。

※服务优势：

1 .高通量定量蛋白分析:多对照组大规模实验分析，发现新的生物标记物;

2.体内体外多种蛋白质标记方法，适用于分析组织、细胞、血液等多种样品;

3.质谱分析灵敏度高，实验结果重复度高;

4.可检测较低丰度蛋白，线性范围广;

5.专业生物信息学分析，分析更系统准确。

三、单细胞质谱流式技术分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm质谱流式系统进行单细胞质谱流式技术分析，采用金属元素标记物（通常是金属元素标记的特异抗体）标记细胞表面和内部的分子，然后用流式细胞原理分离单个细胞，再用电感耦合等离子体质谱（ICP-MS）分析单个细胞的原子质量谱，最后将原子质量谱数据转换为细胞表面和内部的信号分子表达量。

※服务优势：

1.技术先进，填补技术空白

采用金属标记抗体技术，避免了传统流式荧光通道少且易相互影响的问题。可在单细胞层面上对多种指标同时进行表征，百泰派克生物科技可做到同时检测51个目标蛋白。

2.分析数量大，成本较低

单细胞RNAseq受成本等因素限制，所有样本细胞汇总的分析数目一般在2x10^4个左右，而流式质谱技术一次（单样本）就可分析至少10^5的细胞，实现了数量级的提高，且成本不高于单细胞RNAseq。

3.应用前景大

①流式质谱结果可以给出细胞亚群的变化，在临床诊断、疾病机制研究等方面具有极大的研究前景；

②将金属标签技术与其他技术结合会有新应用方向。除常规蛋白外，质谱流式细胞技术还可用于蛋白翻译后修饰；

③可检测细胞存活率、细胞大小、mRNA转录子表达量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现

百泰派克生物科技的基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现一站式解决方案包括我们专有的、高度敏感的免疫肽富集和鉴定方案。我们能够帮助您实现10,000个以上I型多肽和10,000个以上II型多肽的鉴定和识别。通过我们优化的高通量免疫多肽组学分析平台进行免疫肽组学分析，可从最小的样品材料中进行可重复的识别和定量。该服务可以应用于大规模的研究，旨在助力科研工作者寻找癌症、免疫疾病及传染病的解决方案，深入挖掘未知的靶标。

五、生物药物表征

百泰派克基于高分辨率质谱技术，MALDI TOF，高效色谱分离技术，提供一系列完善的生物药物分析方案，从蛋白质、多肽、抗体、疫苗等生物制品的氨基酸组成和一级结构分析，到产品变异性和纯度分析。旨在提供优质生物药物分析服务，帮助生物医药生产商提高生物药物品质。

百泰派克生物科技七大检测平台

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物质谱多组学优质服务商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于为生物/制药和医疗器械行业提供质量控制检测和项目验证等专业服务。公司实验室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法规和指导原则，通过CNAS/ISO9001双重质量体系认证，建立了完备的质量体系，数据冷热/异地备份，设备定期计量/期间核查，软件审计追踪，为客户提供一体化解决方案和技术服务，支持新药研发、药物申报注册和生产放行。

1.公司采用ISO9001质量控制体系，专业提供以质谱为基础的CRO检测分析服务；

2.获国家CNAS实验室认可，为客户提供符合全球药政法规的药物质量研究服务；

3.业务范围覆盖蛋白质组学、多肽组学、代谢组学、生物药物表征、单细胞分析、单细胞质谱流式、生信云分析以及多组学生物质谱整合分析等；

4.七大质量控制检测平台，满足您一站式服务需求；

5.服务3000+企业，10000+客户的选择；

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